捆绑式燃料电池的设计思路是平面型三合一膜电极(EMA, Electrode Membrane Assembly)，几个单电池串联排在膜上。这样的设计适合小功率燃料电池系统。对于较大功率燃料电池系统来说，这种设计的电流密度高，平面式电流收集器的欧姆损失大。与传统电池堆相比，捆绑式电池堆的优点是造型灵活，相邻电池共享密封区，减少了密封面积，电池外框可使用普通塑料，造价低，几个电池共享槽式气体通道，简化了制造工艺。
捆绑式PEMFC设计：1998年汉诺威(Hanover)交易会上展出了一个捆绑式燃料电池系统，用做笔记本电脑的电源。它由25个单电池组成，共串联了5个捆绑结构。由3个微型风扇输送空气，氢气由储氢合金提供，氢气容量可供笔记本电脑工作10ho