在天然气资源缺乏，或石油产品价格低廉的情况下，可使用液态碳氢化合物制氢。碳氢化合物制氢一般采用不完全氧化法。但要加入适量水蒸气，使其发生wGS反应。
反应的设计，应同时考虑两个因素，即使整个反应的热效应是放热，同时又取得较高的氢气产量和含量。
不完全氧化重整反应在有催化剂和无催化剂的条件下都能进行。在无催化剂的情况下，汽油的重整温度在1000℃以上。如此高的温度需要特殊材料制造反应器，反应物也需要预热。使用适当的催化剂可降低重整温度，反应器可用普通材料，如用钢来制造。低温反应还能减少重整产物中Co的含量，而WGS反应器可相应缩小。美国阿根纳国家实验室(ANL)对以汽油为燃料的PEMFC系统研究表明。POX的温度升高，系统效率显著降低。
液态碳氢化合物，如汽油、柴油等，含有硫化物，在重整反应中生成COs和H2S。在燃料使用前必须除去这些能使催化剂中毒的硫化物。在其合成气中，Co的含量较高，需要将Co的含量降低到燃料电池可接受的水平。若还含有碳和灰分，也要过滤除去。另外，液态碳氢化合物在进人重整器前要蒸发、预热。因而，液态碳氢化合物的重整工艺较为复杂。